На старом Запсковье, за восточной частью окольного города, вблизи Гремячей башни находится Мишарина гора, название которой, по преданию, происходит от дьяка Мисюря Мунехина, жившего в первой половине XVI столетия, известного своей благотворительностью и усердием к церквам Божьим. Однако известный краевед Н. Ф. Окулич-Казарин более правдоподобным считал происхождение этого названия от маленьких болот, называемых «мшарами», которыми гора была окружена в древности. Милявица, или Милевка — небольшой ручей, текущий у подножия Мишариной горы.
Церковь на горе построена в 1547 году, каменная. Первоначально храм был монастырским и принадлежал Котельниковой обители. В церкви два престола. Главный — Апостола и Евангелиста Иоанна Богослова, в приделе — святого мученика Иоанна Воина.
Упоминание о Псковском Котельникове монастыре есть в Четьях Минеях митрополита Всероссийского Макария от 1553 года. Над перепиской миней трудились около ста писцов, среди них — псковский инок Касьян с Гремячей горы и писец из Котельникова монастыря с Мишариной горы. Также упоминается мужской Котельников монастырь в писцовой книге под 1623 годом.
Предполагается, что игуменом Котельникова монастыря в 60-е годы XVI века был Василий-Варлаам, который считается автором житий таких святых как: Евфросин Псковский, Александр Невский, Всеволод-Гавриил. Помимо житий, Варлаам, также написал службы и каноны святым Евфросину, Савве Крыпецкому, Нифонту и Георгию Болгарскому. Игумену Варлааму приписывается авторство «Повести о прихождении гордого польского короля Стефана Батория на Богоспасаемый град Псков».
В следствии пожаров, поразивших город в начале XVIII века монастырь был упразднён и храм обращен в приходской с погостом.
Общий вид с юго-запада. Фото С. Морозова. 1988 г.
В 1808 году храм предназначался к сносу как совершенно ветхий, однако Святейший Синод снос церкви не разрешил.
С 1786 по 1808 год к ней приписана церковь Георгия (со Взвоза), в 1834 году приписана церковь святых равноапостольных царя Константина и матери его царицы Елены. В приходе существовали три деревянные часовни: святителя и чудотворца Николая близ деревни Хрястолово и преподобномученицы Анастасии в деревне Горы.
Колокольня построена одновременно с храмом, на ней висели шесть колоколов. Большой колокол весил 36 пудов 16 фунтов, второй и третий колокола — по три пуда каждый, вес четвертого колокола — 2 пуда, пятого и шестого колоколов — по 27 фунтов каждый. На большом колоколе была надпись: «Лит колокол в СПТ.-е купецкий сын Михаил Стуколкин 1845 года мая 5 дня в Псковскую Иоанно-Богословскую Мишаринскую церковь».
В 1882 году псковским купцом Петром Михайловичем Стехновским перед входом в церковь сделана каменная пристройка. В 1892-1893 годах ремонтно-реставрационные работы в храме проведены на средства церковного старосты, почетного гражданина Пскова Ивана Михайловича Кафельникова.
При церкви существовали церковно-приходское попечительство, богадельня, больница; церковно-приходской школы не было.
С 1913 года в церкви служил священник Феодор Васильевич Колобов. В 1927 году после нескольких арестов его выслали на Урал, по другим сведениям — в Сибирь. Его жена последовала за ним, оба они исчезли бесследно. Псаломщиком-дьяконом служил Михаил Лебедев. О его дальнейшей судьбе ничего не известно.
Вид с юго-запада. Фото А. Лебедева. 1988 г.
23 декабря 1936 года Псковский окрисполком принял решение о закрытии церкви, однако по другим сведениям, богослужения в храме продолжались до Великой Отечественной войны. В годы войны церковь получила частичные повреждения кровли, стен, наружной и внутренней отделки. В 1970-1989 годах по проекту В. А. Лебедева проведена реставрация церкви. Однако службы здесь не велись, здание церкви было в небрежении. Решением Псковского горисполкома от 3 марта 1965 года закрыто для массовых захоронений кладбище вокруг церкви.
Возрождение храма святого Иоанна Богослова связано с именем игумена Ионы (Муханова) (4 января 1937 – 19 мая 1999). В середине XX века супруги Мухановы – Александр и Евфросиния приехали в Псково-Печерский монастырь, чтобы принять монашество, но Владыка Иоанн (Разумов) не благословил постриг, а рукоположил Александра во священники, направив в Великие Луки, а затем на служение в Дмитриевский храм и Троицкий кафедральный собор в Пскове. Семья отца Александра жила недалеко от Иоанно-Богословского храма, и, проходя мимо, батюшка постоянно плакал на развалинах. Супруги приняли монашество в 1990 году в честь Псково-Печерских святых игумена Ионы и монахини Вассы, а в 1991 году Владыка Владимир (Котляров) благословил батюшку на восстановление храма.
В 1992 году первые службы совершались на улице, при входе в храм, 1993-й год встречали в приделе святого мученика Иоанна Воина.
25 августа 2001 года архиепископ Псковский и Великолукский Евсевий освятил восемь колоколов, отлитых в Воронеже по старинному способу артелью «Гончаров и Ко».
20 мая 2006 года архиепископ Евсевий освятил Крест мемориала, посвященного священнослужителям храма Иоанна Богослова, игуменам Котельникова монастыря, двумстам русским офицерам, замученным китайскими красноармейцами в Гражданскую войну, и всем здесь погребенным православным христианам.
Сегодня при храме действует детская воскресная школа. Неподалеку от церкви находится база отряда «Зубр». Перед командировками в «горячие точки» по просьбе бойцов совершается молебен «Благословение воинам на брань». Вместе со священником и прихожанами бойцы просят «…силу и крепость на сотрение и попрание крепости супостат».
Вокруг церкви расположено кладбище. Здесь погребены краевед и историк С. А. Цвылёв, реставратор В. П. Смирнов, воины, погибшие при выполнении боевого долга в Чечне.
Адрес: Псков, улица Аллейная, строение 14.
Режим работы: ежедневно с 9:00 до 17:00
Настоятель храма: протоиерей Владимир Саввин
Контактный телефон: +7 (8112)51-50-65
Группа ВКонтакте: https://vk.com/hramioannbogoslov
